Trump mengatakan Turki tidak diperlakukan dengan adil tetapi tidak mengesampingkan sanksi.
Sekitar 250 rudal Stinger juga berada dalam kesepakatan itu dan beberapa peralatan lain yang juga dilaporkan diminta Taiwan.
Sanksi Amerika Serikat (AS) akan diberlakukan di negara itu saat baterai rudal tiba di sekutu NATO Turki.
Sejak protes anti-pemerintah yang damai pada tahun 2011 berubah menjadi konflik habis-habisan, sekitar 375.000 orang telah tewas dan jutaan lainnya mengungsi.
Rudal buatan AS yang diamankan di pangkalan milik komandan militer pemberontak Khalifa Haftar.
Tes membawa model kapsul di atas mesin roket tahap pertama yang diperbarui dari rudal balistik antarbenua Peacekeeper.
Serangan itu menyebabkan kematian dan cedera warga sipil di Sahnaya, selatan Damaskus.
Para pejabat militer Rusia membantah jajaran rudal SSC-8 melanggar perjanjian itu.
Diperlukan enam bulan untuk menarik diri dari perjanjian, yang berarti itu masih berlaku sampai awal Agustus.
Gedung Putih menargetkan sistem komputer yang mengendalikan peluncur roket dan rudal Iran.