Buruknya kualitas udara di wilayah terdampak Karhutla mengakibatkan banyak warga terserang infeksi saluran pernapasan akut (ISPA).
Terdapat tiga penyakit utama yang ditemukan di pengungsian yaitu Diare, Infeksi saluran nafas atas (ISPA) dan gangguan kulit.