Banjir di Terminal 3 akibat hujan deras  menunjukkan sistem saluran air di terminal itu bermasalah. Ini sangat memprihatinkan, bahkan mengenaskan

PT Angkasa Pura II (Persero) bersama dengan kontraktor pembangunan Terminal 3 tengah melakukan evaluasi dan investigasi.

Terdapat dugaan peraturan yang ditabrak di Terminal Ship to Ship Perairan Muara Berau 

APRI meminta KPK dan PPATK percepat pelacakan dan pembekuan aset dari PT Indo Investama Kapital