Jika statusnya naik menjadi negeri, maka pemerintah harus berhitung kembali, karena memiliki tanggung jawab memberikan bantuan keuangan dan struktural.
Penyelenggaraan Ujian Sekolah Berstandar Nasional (USBN) khusus madrasah memiliki dua mata pelajaran tambahan yang akan diujikan
Madrasah negeri hanya lima persen dari total 50 ribuan madrasah, sementara sisanya hingga kini masih berstatus swasta.
Direktoral Jenderal (Ditjen) Pendidikan Islam, menurut Ali, memiliki terlampau banyak kewenangan, sehingga perlu dipecah menjadi tiga ditjen.
Hal tersebut dibuktikan dengan minimnya jumlah madrasah negeri, yakni hanya lima persen dari total 50 ribuan madrasah se-Indonesia.
JPPI menyebut ada perlakuan yang tidak seimbang antara lembaga pendidikan madrasah dan sekolah di Indonesia.
Saat ini, kata Suyitno, madrasah kekurangan 23 ribu guru. Kekurangan itu sedang berupaya dipenuhi lewat skema CPNS sebanyak 12 ribu, dan sisanya melalui seleksi PPPK
Suyitno membeberkan pembayaran tukin guru madrasah periode 2015-2018 sedang berada dalam proses verifikasi dan validasi (verval) by name by address
Pasalnya, hingga saat ini disparitas kualitas madrasah masih tinggi. Apalagi jumlah madrasah negeri hanya lima persen dari total 50 ribuan madrasah.
Muhadjir Effendy mengaku sudah berkoordinasi dengan Kementerian Agama, perihal penerapan sistem zonasi di madrasah